Eine der größten Herausforderungen auf dem Gebiet der Genetik ist es, genetische Varianten hinsichtlich ihres funktionellen Effektes auf das translatierte Protein zu bewerten. Das gesamte Erbgut jedes Menschen enthält viele tausend ''Mutationen'', die letztendlich die genetische Vielfalt der unterschiedlichen Individuen ausmachen. Die große Mehrheit dieser ''Mutationen'' ist allerdings keinesfalls als pathogen anzusehen, sie sorgen dafür, dass jeder Mensch genetisch einzigartig ist. Diese nicht-pathogenen ''Mutationen'' werden auch als genetische Varianten bezeichnet und kommen in einem größeren prozentualen Anteil in der gesamten Weltbevölkerung vor.

Die Schwierigkeit besteht nun darin, Varianten zu bewerten, die nur in einem sehr geringen Teil der Bevölkerung vorkommen und daher eventuell doch pathogen, also krankheitsauslösend sein können. Meistens handelt es sich bei diesen Varianten um sogenannte missense-Varianten, bei denen in der DNA ein Nucleotid gegen ein anderes ausgetauscht ist. Dadurch kann es im daraus resultierenden Protein zu einem Austausch der entsprechenden Aminosäure kommen. Ob dies einen Effekt auf die korrekte Funktionsweise des Proteins hat und damit potenziell pathogen ist, hängt beispielsweise davon ab, wie ähnlich die ausgetauschten Aminosäuren einander sind. In begrenztem Maße lassen sich diese Dinge am Computer simulieren, die Zuverlässigkeit dieser Vorhersagen ist allerdings noch immer stark begrenzt.